コロンビアにおける馬インフルエンザウイルスの系統発生学的および系統地理学的解析

3行まとめ

• コロンビアで発生した馬インフルエンザ罹患馬から得たウイルスの全ゲノム解析と系統地理学的解析を実施した。
• 分離株は米国の流行株と高い相同性を示し、2020年頃に共通祖先をもつ近縁系統であることが判明した。
• 国際的な馬の移動に伴う侵入リスクを考慮し、ゲノム監視体制の構築と適切な予防戦略の策定が求められる。

この論文の要約

目的

コロンビアでは2022年に競技馬を中心とした馬インフルエンザ（EI）の流行が発生した。本研究では、2020〜2023年に同国2地域で臨床徴候を示した馬から得られた馬インフルエンザウイルス（EIV）の完全長ゲノムを対象に、系統発生学的および系統地理学的解析を実施することを目的とした。

対象と方法

EIが疑われる臨床徴候を示した馬から上咽頭検体を採取し、qPCR法で感染を確認した。ナノポアシーケンサーを用いて2株のEIV完全長ゲノムを解読し、国際データベースの参照配列を用いて系統関係の推定、最も近い共通祖先（tMRCA）の分岐年代推定、および全遺伝子セグメントのアミノ酸置換解析を行った。

主な結果

得られた2株のゲノムは、同時期に米国で流行していたH3N8株と90%を超える塩基同一性を共有していた。時間軸解析により、tMRCAは2020年（95%最高事後密度区間：2019〜2021年）と推定された。HA遺伝子およびNA遺伝子で多くの変異が認められ、新規のアミノ酸置換も同定された。なお、解析できた完全長ゲノム数が限られている点が制限事項である。

臨床的意義

コロンビアのEIV株は近年の北米系統と近縁であり、国際的な馬の移動がウイルスの侵入や伝播に関与している可能性が支持された。ウイルスの変異を継続的に追跡し、効果的な予防戦略を講じる上でゲノムサーベイランスが重要である。

⚠️ この要約はAIが自動生成したものです。